A Direcção de Operações e Finanças integra as sub-unidades de Contabilidade e Finanças, Aquisições, Recursos Humanos, Administração, Gestão de Subvenções e Auditoria Interna e Conformidade. As sub-unidades indicadas funcionam de forma integrada para garantir o suporte efectivo com vista o alcance dos objectivos organizacionais consubstanciados na sua visão, missão e valores. A Direcção de Operações e Finanças é responsável pela gestão eficiente de recursos financeiros, implementação e gestão de sistemas operacionais e fluxos processuais, e pelo estabelecimento de sistemas de controlo interno eficazes.
O objectivo da Direcção de Operações e Finanças consiste no apoio eficiente e atempado para a implementação efectiva de actividades programáticas e na gestão racional dos recursos financeiros e materiais, e na gestão estratégica do capital humano para a criação e manutenção de um ambiente de trabalho positivo.